服務介紹
除了常規的mRNA可翻譯蛋白外,在circRNA和lncRNA中也預測到具有翻譯的能力。吉賽生物可提供T系列載體構建和表達驗證服務,驗證“非編碼RNA”是否具備翻譯功能,助力機制研究。
circRNA翻譯驗證載體示意圖
T1: circRNA-OE(circRNA過表達載體)
使用吉賽生物專利技術的第五代circRNA過表達載體進行構建,利用載體攜帶的側翼成環框架(IR)使插入的circRNA序列準確剪切成環表達。包含細胞轉染和qRT-PCR檢測,保證插入的circRNA序列準確剪切成環過表達。
T2:circRNA-3xFlag(含3xFlag標簽的circRNA過表達載體)
在circRNA-OE載體的基礎上,于預測ORF的終止密碼子前添加3xFlag標簽序列,利用載體攜帶的側翼成環框架(IR)使插入的含3xFlag標簽的circRNA序列準確剪切成環表達。包含細胞轉染和qRT-PCR檢測,保證插入的circRNA序列準確剪切成環過表達。
T3:circRNA-3xFlag-△ATG(含3xFlag標簽并突變ATG的circRNA過表達載體)
在circRNA-3xFlag載體的基礎上,突變預測ORF的起始密碼子ATG,利用載體攜帶的側翼成環框架(IR)使插入的含3xFlag標簽的circRNA序列準確剪切成環表達。
T4:circRNA-3xFlag-NC(含3xFlag標簽并刪除下游IR的載體,即不能成環的陰性對照)
在circRNA-3xFlag載體的基礎上,刪除載體下游的成環框架(IR),使能轉錄生成與circRNA-3xFlag相同的RNA序列但不剪切成環。該載體可作為陰性對照使用。
T5:circRNA-3xFlag-**aa(預測ORF的線性表達載體,即**aa的陽性對照)
使用與吉賽生物專利技術的第五代circRNA過表達載體相同骨架(不含成環框架)的載體進行構建,插入預測的ORF全長,使能轉錄生成線性化的ORF全長序列,并能正常翻譯生成預測的多肽**aa。該載體可作為陽性對照使用。
客戶提供
1. 基因ID/物種/全長序列
2. 載體名稱
我們提供
1. T系列翻譯質粒(可選:T1-T5);
2. 目的載體:10μg質粒+200μL甘油菌;
3. 對照載體:10μg質粒+200μL甘油菌;
4. 載體構建與驗證實驗報告:
① 載體構建步驟;
② 載體測序驗證結果原始文件;
③ 細胞轉染實驗步驟;
④ qPCR實驗流程方案及產物測序;
⑤ 載體構建與驗證實驗報告。
案例1:
參考文獻:
Song R, Guo P, Ren X, Zhou L, Li P, Rahman NA, Wo?czyński S, Li X, Zhang Y, Liu M, Liu J, Li X. A novel polypeptide CAPG-171aa encoded by circCAPG plays a critical role in triple-negative breast cancer. Mol Cancer. 2023 Jul 5;22(1):104. doi: 10.1186/s12943-023-01806-x. PMID: 37408008; PMCID: PMC10320902.
案例2:
參考文獻:
Tang X, Deng Z, Ding P, Qiang W, Lu Y, Gao S, Hu Y, Yang Y, Du J, Gu C. A novel protein encoded by circHNRNPU promotes multiple myeloma progression by regulating the bone marrow microenvironment and alternative splicing. J Exp Clin Cancer Res. 2022 Mar 8;41(1):85. doi: 10.1186/s13046-022-02276-7. PMID:35260179; PMCID: PMC8903708.
Q: T3載體構建,只突變起始密碼子ATG不刪除后面的ATG會有影響嗎?
A:現有文章都是使用突變以減少對蛋白結構的改變,后續其他ATG刪除的話會大大影響蛋白的結構,可能會引起不必要的改變。而且翻譯是很復雜的機制,并不是遇見ATG就起始翻譯,還需要其他序列協助才可以。