服務介紹
對微生物群體進行高通量測序,通過數據分析特定環境中微生物群體基因組成及功能,研究微生物多樣性、種群結構、生物進化與環境之間的關系,解讀微生物群體多樣性與豐度,微生物與宿主之間的關系,發掘和研究新的、具有特定功能的基因,挖掘具有應用價值的基因資源,應用于開發新的微生物活性物質。
微生物宏基因組測序技術路線
測序方案
測序平臺:Illumina Novaseq 6000/NovaSeq X Plus
測序模式:PE150
測序數據量:5-10 Gb raw data
生物信息分析
基礎分析
物種組成和豐度統計
樣品復雜度分析
樣品間物種豐度差異分析
基因組組裝
基因組組分分析
基因功能GO-COG注釋
基因功能KOG、KEGG注釋
自定義分析
多樣品顯著相關因子分析
與疾病相關的基因的深度分析
菌群共生關系網絡構建
系統進化樹構建
Table1.宏基因組測序原始樣本送樣建議
送樣類型 | 送樣量 | 備注 |
糞便、土壤等環境樣本 | ≥2g |
Table2.宏基因組測序DNA樣本送樣建議
送樣類型 | 送樣量 | 濃度 | 純度 |
DNA | ≥4μg | ≥30ng/μl | 無蛋白/鹽離子等污染 |
*更具體的送樣方法請詳詢銷售或技術支持
物種范圍:常見有參微生物,詳詢銷售或技術支持