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miRNA-seq
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服務介紹
小RNA主要包括miRNA、siRNA、snoRNA和piRNA等，是生命活動重要的調控因子，在基因表達調控、生物個體發育、代謝及疾病的發生等生理過程中起著重要的作用。由于小RNA測序技術的應用，越來越多的miRNA被發現和鑒定，并廣泛應用于疾病診斷、個性化治療和預后等領域。
小RNA測序技術路線
測序方案
測序平臺：Illumina Novaseq 6000/NovaSeq X Plus測序模式：PE150
測序數據量：10 M raw reads
生物信息分析
基礎分析
原始數據質控檢查（堿基質量評估，序列質量評估）
比對結果質控檢查
RNA種類分析統計
miRNA表達分析
基于miRNA表達的樣品主成分分析
miRNA差異分析
差異 miRNA 靶基因預測
差異 miRNA 靶基因的GO功能分析
差異 miRNA 靶基因的KEGG通路分析
差異 miRNA 靶基因的Rectome通路分析
高級分析（可結合mRNA測序結果）
差異miRNA與差異表達基因調控分析
差異miRNA與差異表達基因網絡繪圖
部分結果示例
圖1：外泌體中共表達和特異性表達的miRNAs維恩圖
圖2：火山圖展示HFD-exos與NCD-exos的表達差異倍數
圖3：miRNA靶基因網絡圖
Table1. miRNA-seq原始樣本送樣建議
送樣類型
送樣量
備注
細胞上清
≥30mL
無支原體污染
血清、血漿
≥4mL
Table2. miRNA-seq RNA樣本送樣建議
送樣類型
送樣量
完整性（RIN值）
濃度
其他
純度
total RNA
≥1μg
≥7
≥100ng/μl
無DNA，蛋白/鹽離子等污染，樣本無色透明不粘稠
血清血漿、細胞上清、外泌體RNA
≥40ng
/
/
DV200>30%
FFPE組織RNA
≥4μg
≥3
/
DV200>30%
RIP RNA、pulldown RNA
≥200ng，如≤10ng,則采用微量建庫
/
/
*更具體的送樣方法請詳詢銷售或技術支持
物種范圍：人、小鼠、大鼠等物種，其余物種請詳詢銷售或技術支持
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