服務(wù)介紹

運(yùn)用針對(duì)目標(biāo)蛋白的抗體把相應(yīng)的RNA-蛋白復(fù)合物沉淀下來，經(jīng)過分離純化獲得結(jié)合在復(fù)合物上的RNA，再通過高通量測序?qū)崿F(xiàn)對(duì)目的RNA的信息分析。RIP技術(shù)與高通量測序的結(jié)合，能幫助研究人員更好的了解癌癥以及其它疾病整體水平的RNA變化。

RNA免疫共沉淀測序技術(shù)路線

測序方案

測序平臺(tái)：Illumina Novaseq 6000/NovaSeq X Plus

測序模式：PE150

測序數(shù)據(jù)量：10 Gb raw data

生物信息分析

原始數(shù)據(jù)質(zhì)控檢查（堿基質(zhì)量評(píng)估，序列質(zhì)量評(píng)估）

比對(duì)結(jié)果質(zhì)控檢查

基因覆蓋度分析

基于基因表達(dá)的樣品主成分分析

富集基因表達(dá)分析

富集基因GO功能分析

富集基因KEGG通路分析

富集基因Rectome通路分析

富集環(huán)狀RNA的預(yù)測及鑒定

富集circRNA宿主基因的GO功能分析

富集circRNA宿主基因的KEGG通路分析

富集circRNA宿主基因的Rectome通路分析

富集circRNA的靶向miRNA預(yù)測分析

富集circRNA及靶向miRNA網(wǎng)絡(luò)調(diào)控制圖

富集長鏈非編碼RNA表達(dá)分析

富集lncRNA順式調(diào)控基因的GO功能分析

富集lncRNA順式調(diào)控基因的KEGG通路分析

富集lncRNA順式調(diào)控基因的Rectome通路分析

部分結(jié)果示例

圖1. 富集基因的GO功能分析展示

圖2. 富集lncRNA的Reactome通路分析展示

圖3. 富集circRNA-miRNA網(wǎng)絡(luò)圖展示

Table1. RIP-seq RNA樣本送樣建議

*更具體的送樣方法請(qǐng)?jiān)斣冧N售或技術(shù)支持

物種范圍：人、小鼠、大鼠，其余物種請(qǐng)?jiān)斣冧N售或技術(shù)支持