服務(wù)介紹

Exosome能夠通過生物屏障，在細(xì)胞間傳遞功能性核酸分子，從而發(fā)揮各種生物學(xué)功能，有望成為一種新型給藥途徑及基因治療載體。吉賽生物自主研發(fā)外泌體提取試劑盒，能夠快速分離提取exosome RNA進(jìn)行建庫測序，滿足外泌體mRNA，lncRNA，circRNA，miRNA的不同研究需求。

外泌體RNA測序技術(shù)路線

測序方案

分析對(duì)象：mRNA+lncRNA+circRNA

測序平臺(tái)：Illumina Novaseq 6000/NovaSeq X Plus

測序模式：PE150

測序數(shù)據(jù)量：10 Gb raw data

分析對(duì)象：miRNA

測序平臺(tái)：Illumina Novaseq 6000/NovaSeq X Plus

測序模式：PE150

測序數(shù)據(jù)量：10 M raw reads

生物信息分析

外泌體全轉(zhuǎn)錄組測序丨Exo-RNA-seq(mRNA+lncRNA+circRNA)

基礎(chǔ)分析

原始數(shù)據(jù)質(zhì)控檢查

比對(duì)結(jié)果質(zhì)控檢查

基因覆蓋度分析

基于基因表達(dá)的樣品主成分分析

基因表達(dá)分析

circRNA預(yù)測及鑒定

長鏈非編碼RNA的識(shí)別

高級(jí)分析

差異基因表達(dá)分析

差異基因GO功能分析

差異基因KEGG通路分析

差異基因Rectome通路分析

針對(duì)mRNA基因的GSEA分析

circRNA差異分析

差異circRNA宿主基因的GO功能分析

差異circRNA宿主基因的KEGG通路分析

差異circRNA宿主基因的Rectome通路分析

差異circRNA的靶向miRNA預(yù)測分析

差異circRNA及靶向miRNA網(wǎng)絡(luò)調(diào)控制圖

長鏈非編碼RNA的識(shí)別

長鏈非編碼RNA差異分析

差異lncRNA順式調(diào)控基因的GO功能分析

差異lncRNA順式調(diào)控基因的KEGG通路分析

差異lncRNA順式調(diào)控基因的Rectome通路分析

外泌體miRNA測序丨Exo-miRNA-seq

基礎(chǔ)分析

原始數(shù)據(jù)質(zhì)控檢查

比對(duì)結(jié)果質(zhì)控檢查

RNA種類分析統(tǒng)計(jì)

miRNA表達(dá)分析

基于miRNA表達(dá)的樣品主成分分析

miRNA差異分析

差異 miRNA 靶基因預(yù)測

差異 miRNA 靶基因的GO功能分析

差異 miRNA 靶基因的KEGG通路分析

差異 miRNA 靶基因的Rectome通路分析

高級(jí)分析

差異miRNA與差異表達(dá)基因調(diào)控分析

差異miRNA與差異表達(dá)基因網(wǎng)絡(luò)繪圖

Table1. 外泌體測序原始樣本送樣建議

Table2. 外泌體測序樣本送樣建議

*更具體的送樣方法請(qǐng)?jiān)斣冧N售或技術(shù)支持

物種范圍：人、小鼠、大鼠等哺乳動(dòng)物，擬南芥、水稻、番茄、玉米、大豆等植物，其他物種詳詢銷售或技術(shù)支持

Q1：外泌體全轉(zhuǎn)錄組測序，提取出來的RNA有100~200ng。是采用微量建庫的方法建庫，還是常規(guī)建庫方法建庫呢？

A1：如果提取出來的RNA量超過100ng，建議采用常規(guī)去rRNA鏈特異方法，用100ngRNA進(jìn)行全轉(zhuǎn)錄組建庫。相對(duì)來說，建庫input的模板量越大，基因信息的覆蓋度越高。微量建庫方法是在樣本量較少的情況下采用的建庫方法，在可以的情況下，盡量采用常規(guī)建庫方法進(jìn)行實(shí)驗(yàn)。

Q2：外泌體研究，應(yīng)選用血漿還是血清？

A2：血清是血液凝固之后收集的液體，其中少了纖維蛋白原，凝血因子，以及多了很多凝血產(chǎn)物。纖維蛋白原可轉(zhuǎn)化為纖維蛋白，具有凝血功能。在凝血過程中血小板會(huì)分泌大量的外泌體，有研究發(fā)現(xiàn)血清中有接近50%的外泌體來自額外的分泌。

血漿=血液-血細(xì)胞

血清=血漿-纖維蛋白原-凝血因子

所以一般實(shí)驗(yàn)選擇血漿，在特殊情況下，如研究與血小板相關(guān)的疾病的時(shí)候，血清更適合。