服務(wù)介紹
熒光素酶報(bào)告實(shí)驗(yàn)是指以熒光素為底物來檢測熒光素酶活性的一種報(bào)告基因系統(tǒng),通過熒光測定儀檢測該報(bào)告基因系統(tǒng)中釋放的生物熒光,從而反映基因是否存在靶向互作。
技術(shù)優(yōu)勢
1. 靈敏度高,比Western blot靈敏度高1000倍以上;
2. 內(nèi)源性低,哺乳動物無內(nèi)源性表達(dá);
3. 熒光素酶檢測不受細(xì)胞內(nèi)其他物質(zhì)影響;
4. 發(fā)光檢測,檢測方便;
5. 檢測范圍廣;
6. 采用瞬時(shí)轉(zhuǎn)染技術(shù),操作簡便、快速,周期短,適用于絕大多數(shù)細(xì)胞類型。
客戶提供
1. circRNA可提供circBase/circBank ID;mRNA/lncRNA可提供轉(zhuǎn)錄本ID(如NCBI編號NM_001126113.2);
2. 結(jié)合位點(diǎn)信息:預(yù)測結(jié)合位點(diǎn)圖片或文檔(具體序列);
3. 檢測使用的細(xì)胞;
4. 雙熒光素酶檢測的分組信息。
我們提供
1. 質(zhì)粒10μg+菌液200μl;
2. 載體構(gòu)建+雙熒光素酶實(shí)驗(yàn)報(bào)告;
3. 剩余的模擬物。
案例1
參考文獻(xiàn):
Li Y, Pan D et al. Silencing ATF3 Might Delay TBHP-Induced Intervertebral Disc Degeneration by Repressing NPC Ferroptosis, Apoptosis, and ECM Degradation. Oxid Med Cell Longev. 2022 :4235126.
案例2
參考文獻(xiàn):
Ma L et al. Silencing of circRACGAP1 sensitizes gastric cancer cells to apatinib via modulating autophagy by targeting miR-3657 and ATG7. Cell Death Dis. 2020 , 11(3):169.
模擬物與靶基因作用情況
抑制劑與靶基因作用情況
1、雙熒光素酶實(shí)驗(yàn)檢測數(shù)值太低是什么原因?
正常表達(dá)水平下,熒光值的數(shù)量級應(yīng)在10 4次方-10 7次方數(shù)量級左右,導(dǎo)致數(shù)值低主要有以下幾個(gè)原因:啟動子活性、轉(zhuǎn)染效率低、裂解不充分、底物失效、操作不規(guī)范等原因,具體的原因需要實(shí)驗(yàn)者進(jìn)行排查。
1.1 轉(zhuǎn)染效率低
a. 優(yōu)化轉(zhuǎn)染實(shí)驗(yàn)條件,用較易轉(zhuǎn)染的質(zhì)粒做陽性對照(如轉(zhuǎn)染過表達(dá)熒光蛋白質(zhì)粒);
b. 確保轉(zhuǎn)染DNA的質(zhì)量,可通過酶切或瓊脂糖凝膠電泳的方法對DNA質(zhì)量進(jìn)行鑒定;
c. 選擇活性較高,處于指數(shù)分裂期的細(xì)胞進(jìn)行轉(zhuǎn)染。
1.2 啟動子活性低或誘導(dǎo)失敗
a. 轉(zhuǎn)染后的細(xì)胞培養(yǎng)使用特異性誘導(dǎo)啟動子的條件;
b. 優(yōu)化細(xì)胞的培養(yǎng)條件,提高熒光素酶的表達(dá)量;
c. 更換強(qiáng)啟動子(如SV40、CMV)。
注:海腎熒光素酶基因作為內(nèi)對照,其表達(dá)應(yīng)不受時(shí)期、部位、環(huán)境影響,因此常用組成型表達(dá)的TK啟動子。
1.3 樣品裂解效率低
a. 細(xì)胞培養(yǎng)時(shí)間不宜過長,12-36h內(nèi)最好,長時(shí)間培養(yǎng)后,細(xì)胞可能會難裂解。
b. 加入的裂解液需足量,保證細(xì)胞能夠充分裂解。
1.4 檢測過程操作不規(guī)范
a. 選擇合適的檢測儀器,能夠檢測化學(xué)發(fā)光或者生物發(fā)光的儀器都適用于該實(shí)驗(yàn);
b. 需加入足量底物,保證底物的飽和,否則會造成檢測結(jié)果出現(xiàn)很大偏差;
c. 室溫反應(yīng)。反應(yīng)時(shí)各個(gè)組分(細(xì)胞裂解產(chǎn)物,底物工作液等)都需要調(diào)整到室溫;
d. 熒光素酶的半衰期一般約30min,加完底物后可立即檢測,盡量在30min內(nèi)完成裂解。
1.5 底物氧化失效
a. 底物避光密封保存,螢火蟲熒光素酶底物-20℃保存;海腎熒光素酶底物推薦-80℃保存;
b. 反應(yīng)工作液建議現(xiàn)用現(xiàn)配。
2、雙熒光素酶熒光值過高的原因?
熒光值過高可能會超出儀器檢測范圍,從而檢測不到值,一般讀數(shù)在5-6位之間較好。熒光值過高可通過以下方式嘗試解決:
a. 減少質(zhì)粒轉(zhuǎn)染量;
b. 細(xì)胞樣品裂解后,離心取上清后檢測或?qū)α呀猱a(chǎn)物進(jìn)行稀釋后檢測。
注:不建議通過減少底物量來降低熒光值,需要保證底物的飽和來反映熒光素酶真實(shí)的表達(dá)水平,否則會造成檢測結(jié)果出現(xiàn)大的偏差。
3、雙熒光素酶復(fù)孔差異大怎么辦?
雙報(bào)告基因檢測系統(tǒng)較為靈敏,檢測結(jié)果受多種因素的影響,因此,一般設(shè)置3個(gè)或3個(gè)以上的復(fù)孔,復(fù)孔之間有差異是正常的,差異在同一個(gè)數(shù)量級可以接受。想要得到更準(zhǔn)確的實(shí)驗(yàn)結(jié)果,需盡量減少復(fù)孔的差異性,建議如下:
1、裂解后建議離心取上清,保證樣本均一性;
2、保證加樣的準(zhǔn)確性;
3、樣品和底物混合后到檢測前的時(shí)間以及檢測時(shí)間應(yīng)控制在相同的時(shí)間內(nèi)。